一、根據產品應用范圍來區分：

　　1、普通全自動凝膠成像分析系統：適用于對蛋白凝膠電泳(考馬斯染色，銀染)等可見光樣品，以及DNA/RNA（EB、TLC plates、SYBR Green）等紫外；進行圖象采集并進行定性和定量分析；

　　2、化學發光全自動凝膠成像分析系統：適用于化學發光/紫外光/可見光凝膠成像分析系統，如ECL、ECL PLUS、Southern、CDP Star、CSPD、Northern和Western雜交的化學發光等各種化學發光暴光后的樣品檢測；

　　3、多色熒光全自動凝膠成像分析系統：適用于熒光/化學發光/可見光凝膠成像分析系統，如：EB 、TLC plates、GFP plates、SYBR Green、SYBR Gold、SYBR Safe、Sypro Red、Sypro Orange、Texas Red、Rhodamine Red、Fluorescein、Deep Purple、Cy2、Cy3、Cy3.5、Cy5、熒光板等的樣品檢測；

　　4、多功能活體全自動凝膠成像分析系統 ：適用于生物發光（bioluminescence）與熒光（fluorescence）兩種技術。生物發光是用熒光素酶(luciferase)基因標記細胞或DNA，而熒光技術則采用熒光報告基團（GFP、RFP）,或 Cyt及dyes等熒光染料進行標記。

　　三、全自動凝膠成像分析系統的組成

　　凝膠成像系統的基本骨包含：CCD相機，暗室和分析軟件。不過其功能不僅于對瓊脂糠凝膠進行成像，現在的成像儀趨向于多功能化，還適用于蛋白膠、發熒光的膠、印跡膜和菌落平板等應用。在Western Blot方面，高性能的CCD分子成像系統能與膠片媲美。

　　CCD是電荷耦合器件（Charge Coupled Device）的英文名稱縮寫，是一種光電轉換器件。是凝膠圖像系統的核心部件。絕大多數對數碼相機都有一定的了解，不少人還是這方面的專家。有人把數碼相機的像素看得很重，但比較之后發現，有些400萬、500萬像素的相機拍出來的片子沒有300像素的機子拍出來的好，這是為什么？

　　其實，影響成像的因素很多，衡量CCD好壞的指標，有分辨率，CCD尺寸，動態范圍,靈敏度，量子效率，信噪比等，其中像素數以及CCD尺寸是重要的指標。其實是說感光器件的面積大小，這里就包括了CCD感光器件的面積越大，也即CCD面積越大，捕獲的光子越多，感光性能越好，信噪比越低。

　　四、現在分子全自動凝膠成像分析系統的選擇大致來看有這樣的趨勢：

　　1、專業研究分子生物學的在以前已經裝配了普通凝膠成像分析系統，這兩年有一些有遠見教授或者研究到化學發光成像和多色熒光成像方向的實驗室已經裝配了，化學發光成像分析系統，多色熒光成像分析系統，這有部分已經有一定的數量了。極少數實驗室也裝配了多功能活體成像分析系統，這在全國是屬于極少數的。

　　2、第二類是研究和生物相關的交叉和邊緣學科實驗室，才剛剛裝配普通凝膠成像分析系統，并且這部分老師對分子影像成像分析系統還沒有完整的了解和系統的操作，他們選擇子影像成像分析系統更沒主意。

　　3、從現在大的發展方向來看，專業研究分子生物學的已經在普通全自動凝膠成像分析系統的基礎之上開始向化學發光成像分析系統，多色熒光成像分析系統走的趨勢，但是在這中間有一個很大的問題就是絕大多數的老師很想向化學發光成像分析系統，多色熒光成像分析系統，做并且他們有很多已經做到這個方向，但是這些老師沒有接觸過過化學發光全自動凝膠成像分析系統，多色熒光成像分析系統，對他們的具體的功能和操作都沒有足夠的知識，特別是在熒光染料的選擇上面和實際的動物及各種樣本的處理方面有一定得難度。